Clockstoppers spielt im typisch amerikanischen High School Milieu. Hauptdarsteller Zak kommt durch Zufall in den Besitz einer geheimnissvollen Armbanduhr und steht somit ungewollt vor dem grössten Abenteuer seines zarten Teenagerlebens. Diese Uhr, die im Zentrum des Geschehens steht, verleiht Zak eine übernatürliche Macht über Zeit und Raum: Die Umwelt erstarrt, jeder Gegenstand und jedes Lebewesen erscheint wie in Zeit eingefroren. Doch er ist nicht allein in „Hypertime“, dem Zustand der durch die Bedienung der Uhr ausgelöst wird. Geheimagenten, die sich bei näherer Betrachtung als eine Handvoll Ganoven entpuppen, wollen diese übernatürliche Macht an sich reissen und für Ihre dubiosen Zwecke nutzen. Auf geradezu heimtückische Weise kidnappen sie Zaks Dad, seines Zeichens ein anerkannter Wissenschaftler.
Jetzt gilt es für Zak, mit Unterstützung der hübschen Austauschschülerin Franscesca, nicht nur seinen Vater retten, vielmehr muss er die ganze Welt vor der Machtübernahme dieser Ganovenbande bewahren. Es kann für alle Beteiligten lebensbedrohlich sein, falls die Uhr in falsche Hände fällt.